| obdobie | označenie | koord./riešiteľ | názov |
| 2024 - 2025 | APVV SK-SRB-23-0044 | Kalina Martin | Bipolárny prístup v matematických modeloch rozhodovacích procesov |
| 2022 - 2025 | H2020 Excellence (MSCA) 945478 | Mikula Karol | Numerical methods for computational evolving manifolds – NMCEM |
| 2020 - 2025 | H2020 Excellence (MSCA) 955576 | Mikula Karol | Training European Experts in Inflammation: from the molecular players to animal models and the bedside |
| 2017 - 2020 | Horizont 2020 (MSCA) 721537 | Mikula Karol | ImageInLife – Training European Experts in Multilevel Bioimaging, Analysis and Modelling of Vertebrate Development and Disease |
| 2017 - 2019 | 4000122230/17/NL/SC | Čunderlík Róbert | GOCE-based high-resolution gravity field modelling in a space domain |
| 2011 - 2014 | ESF-EC-0009-10 | Širáň Jozef | Geometrické reprezenácie a symetrie grafov, máp a iných diskrétnych štruktúr s aplikáciami vo vede |
| 2009 - 2010 | SK-AT-0020-08 | Bacigál Tomáš | Viacrozmerné modely závislosti v hydrológii |
| 2006 - 2010 | 028892 | Mikula Karol | BioEMERGENCIES |
| 2008-2009 | SK-SRB-0019/07 | Mesiar Radko | Modelovanie informačných systémov pomocou výpočtovej inteligencie za prítomnosti neurčitosti |
| 2006-2009 | 6.RP 028892 | Mikula Karol | BioEMERGENCIES |
| 2006-2008 | JPD 3-082/2005 - 13120120271 | Handlovičová Angela | Kompletná jazyková transformácia a personálne zabezpečenie študijného programu matematicko-počítačové modelovanie |
| 2006 - 2007 | APVV-SK-68/CZ-68 | Mikula Karol | Modern methods of mathematical modeling and numerical simulations in technical and physical sciences |
| 2005-2008 | 6.RP 012916-2 | Mikula Karol | EMBRYOMICS: Časová a priestorová rekonštrukcia bunkového rodokmeňa |
